Missing coverage evidence...
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ATGGTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTGGCGG  >  minE/1053171‑1053231                                                             | aTGGTGCACGGTGGTCAGGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:171416/61‑1 (MQ=255)    gTCCACTGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:972712/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTtgcgg  <  1:820377/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:585562/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:76410/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:762198/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:750372/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:659514/58‑1 (MQ=255)    gTCCACGGTGGTCACGCCGAGATCCAGATGCTCTTCAATAAAACTGACCAGCTggcgg  <  1:653683/58‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑