Missing coverage evidence...
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ACACCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTG  >  minE/1102000‑1102061                                                              | acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:8264/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:648204/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:100753/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:709100/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:757375/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:758462/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:773886/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:774662/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:784153/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:799873/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:80323/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:809799/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:669105/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:841708/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:851667/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:861354/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:882496/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:883412/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:888613/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:899978/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:909288/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:911461/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:936911/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:965596/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:330039/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:126180/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:143819/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:176325/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:189104/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:198905/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:201670/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:205858/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:300139/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:62953/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:351113/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:421301/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:579149/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:540140/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:441670/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:419698/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:396038/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGGCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:403298/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGTCGCCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:888303/62‑1 (MQ=255) acacCGATTGTGGCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:894894/62‑1 (MQ=255)  gacCGATTGTGTCGTCTCGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:331377/60‑1 (MQ=255)     cGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:354151/58‑1 (MQ=255)              cgtcACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:320680/49‑1 (MQ=255)              cgtcACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:279680/49‑1 (MQ=255)                 cACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:295623/46‑1 (MQ=255)                 cACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:692818/46‑1 (MQ=255)                    ggTCACCGAGCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:432618/43‑1 (MQ=255)                           gATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTg  <  1:750566/36‑1 (MQ=255)                                                              | ACACCGATTGTGTCGTCACGGTCACCGATCTCGCCGATCAGCAAGCCTTTGCTGAAGCCCTG  >  minE/1102000‑1102061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑