Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 85633 85945 313 112 [0] [0] 9 murC UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

CATTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGG  >  minE/85571‑85632
                                                             |
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGGCAATGAAgg  <  1:936175/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:850888/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:823404/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:589938/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:825140/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:559368/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:827229/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:497679/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:481607/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:477493/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:810368/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:475024/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:46469/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:453903/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:433722/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:851497/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:390374/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:37584/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:387427/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:598575/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:611644/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:801634/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:614895/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:800388/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:641233/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:643351/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:798092/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:671599/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:681044/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:685103/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:778795/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:709201/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:71875/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:76787/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:959486/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1030774/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:104192/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1030348/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:128981/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:92357/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:102293/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:165032/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:916360/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:904003/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:182582/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:952200/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:184994/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:188995/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:205924/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:228331/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:88009/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:252140/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:27522/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:878045/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:87523/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:32968/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:332119/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:872668/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:350128/62‑1 (MQ=255)
catTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTAGCCAATGAAgg  <  1:976599/62‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGTGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:425189/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:892025/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:971475/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:789515/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:925149/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:919100/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:863532/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:884563/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:847545/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:573900/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:686312/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1011827/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1016887/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:102115/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:126808/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:149523/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:177541/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:184057/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:219310/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:308216/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:32784/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:334556/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:370023/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:476814/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:487737/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:511360/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:411471/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1001180/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:590093/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:593973/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:743865/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:61438/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:680846/61‑1 (MQ=255)
 atTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:618311/61‑1 (MQ=255)
  ttttGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:1003650/60‑1 (MQ=255)
  ttttGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:140361/60‑1 (MQ=255)
  ttttGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:242367/60‑1 (MQ=255)
         ggCATTGGTGGTGCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:174271/53‑1 (MQ=255)
                   gtgCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:651259/43‑1 (MQ=255)
                           aTGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:102752/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
CATTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGG  >  minE/85571‑85632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: