Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1126732	1127150	419	21 [0]	[0] 17	pheM–[rplT]	pheM,[rplT]

TGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTC  >  minE/1126671‑1126731                                                             | tGGACTTAGAGCCTATCCCCTCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:261284/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:618533/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:923939/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:889905/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:814853/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:783264/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:764649/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:751416/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:744646/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:685546/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:636429/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:635925/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:151263/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:54642/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:523472/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:438933/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:406138/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:328010/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:279399/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:270834/1‑61 (MQ=255) tGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTc  >  1:21571/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGGACTTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCCATTTTGGTCCCGGGCTGTGCTC  >  minE/1126671‑1126731

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑