Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1128349	1128459	111	84 [0]	[0] 31	thrS	threonyl‑tRNA synthetase

ACGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGT  >  minE/1128288‑1128348                                                             | actgTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTTTTCCTCCAATTGt  <  1:602697/58‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:553699/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:715991/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:705448/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:693540/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:690979/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:678678/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:642639/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:638446/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:622861/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:613135/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:728411/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:546003/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:542724/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:540465/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:51467/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:505360/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:484116/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:481491/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:481150/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:480397/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:892296/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:976485/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:969476/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:963638/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:963302/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:949328/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:944370/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:924706/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:91247/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:902457/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:1008141/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:883963/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:847908/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:842742/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:83987/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:827990/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:805756/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:768812/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:752947/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:728459/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:172733/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:312145/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:299786/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:283250/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:270475/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:26295/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:248696/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:247977/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:230387/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:216323/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:471547/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:159832/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:144571/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:140214/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:118899/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:114281/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:1020772/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:101924/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:1012845/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:1003224/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:333819/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:477325/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:470712/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:465501/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:443469/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:442021/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:427070/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:406244/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:396780/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:395614/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:384240/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:341447/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:338201/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:33361/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGGTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:42885/61‑1 (MQ=255) aCGGTTAGGGCGCGCCGTTAGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:9103/61‑1 (MQ=255)  cGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:151860/60‑1 (MQ=255)             cgcCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:352364/49‑1 (MQ=255)                 gTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:3512/45‑1 (MQ=255)                    tGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:349425/42‑1 (MQ=255)                      aaCTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:979545/40‑1 (MQ=255)                       aCTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:674247/39‑1 (MQ=255)                           gTTTTCGGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGt  <  1:453180/35‑1 (MQ=255)                                                             | ACGGTTAGGGCGCGCCGTTTGAACTCGTTTTCCGCCTTTAATACCTTATTCCTCCAATTGT  >  minE/1128288‑1128348

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑