Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1128548	1129292	745	59 [0]	[0] 89	thrS	threonyl‑tRNA synthetase

ATATGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGT  >  minE/1128486‑1128547                                                              | atatGTGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:504127/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCTGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:954873/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:816942/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:585712/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:591661/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:649130/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:675872/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:728741/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:730142/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:760110/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:769931/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:770333/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:776514/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:789565/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:793834/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:808145/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:584123/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:843723/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:849192/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:877153/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:880212/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:924873/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:933608/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:936136/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:960216/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:960914/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:967137/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:970766/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:987163/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:289656/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:105434/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:107260/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:108305/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:124302/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:1296/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:14756/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:19409/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:200068/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:203863/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:22643/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:263357/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:283169/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:303868/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:328017/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:347975/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:409789/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:445804/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:480593/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:495047/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:495066/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:508209/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:512578/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:515489/62‑1 (MQ=255) atatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:539450/62‑1 (MQ=255)  tatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCTATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:210983/61‑1 (MQ=255)  tatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:1013007/61‑1 (MQ=255)  tatGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:663122/61‑1 (MQ=255)       gacgcgacgcAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:382329/56‑1 (MQ=255)                       tgCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGt  <  1:961552/40‑1 (MQ=255)                                                              | ATATGGGACGCGACGCAAAGTGTGCTCGCGGATTTTAAAGCCAATCTTCTCATTTCTCAAGT  >  minE/1128486‑1128547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑