Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1153373	1153500	128	96 [0]	[0] 27	spy/astE	envelope stress induced periplasmic protein/succinylglutamate desuccinylase

TTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTG  >  minE/1153309‑1153372                                                                | ttACGCATATTC‑‑TATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:251071/62‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:684001/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:829593/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:825660/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:814803/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:782735/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:763445/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:755262/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:740330/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:717745/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:711520/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:691664/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:686826/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:832580/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:66187/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:643557/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:636094/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:631361/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:622491/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:622268/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:589239/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:575192/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:56652/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:561290/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:1010167/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:936157/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:998172/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:995627/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:994149/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:993193/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:992992/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:991844/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:99010/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:981488/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:97447/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:964828/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:964325/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:560610/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:902071/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:894153/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:878616/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:871706/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:869964/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:866990/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:854766/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:851981/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:843906/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:839095/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:204049/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:332019/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:560434/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:311008/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:302289/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:297595/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:293655/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:263221/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:250617/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:249361/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:219258/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:316681/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:19883/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:183968/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:182502/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:177812/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:160506/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:132719/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:129784/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:114806/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:1025583/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:413645/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:496996/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:479898/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:499438/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:507472/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:513969/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:471783/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:423180/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:40093/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:522437/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:535195/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:53728/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:548898/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:392551/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:374920/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:359432/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATCTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:480246/61‑1 (MQ=255)    cGCATATTCTATATCCTTCCCTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:14067/61‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:343874/60‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:217774/60‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:218961/60‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:394693/60‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:740898/60‑1 (MQ=255)     gCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:314600/60‑1 (MQ=255)         atTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:478320/56‑1 (MQ=255)            cTATATCCTTCCTTTCATTTTTTTATTACGGCTTTATTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:25104/53‑1 (MQ=38)                          tCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtg  <  1:729399/39‑1 (MQ=255)                                                                | TTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTG  >  minE/1153309‑1153372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑