Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1207222 1207355 134 59 [0] [0] 12 manY mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

ACGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGACGCCGC  >  minE/1207160‑1207221
                                                             |
atgCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:203890/60‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:65193/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:442467/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:475557/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:478780/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:480041/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:480275/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:483821/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:501423/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:561521/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:583070/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:613182/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:640886/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:642860/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:101308/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:653351/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:677918/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:703325/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:754453/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:780849/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:793174/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:864773/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:900022/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:956354/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:96169/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:981913/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:269089/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:1002606/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:148834/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:170106/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:171679/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:174825/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:178629/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:199975/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:224567/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:236346/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:255695/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:42564/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:28320/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:413446/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:309675/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:312000/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:371560/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:322212/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:343182/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:370726/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:34872/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGAGCCTGAcgccgc  <  1:320136/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGGGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:760343/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCGGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:803591/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGATCGCGCGGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:447041/62‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAAATGAACGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:612954/62‑1 (MQ=255)
 cGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:133711/61‑1 (MQ=255)
    tGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:826126/58‑1 (MQ=255)
        aaTGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:608766/54‑1 (MQ=255)
          tGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:198300/52‑1 (MQ=255)
          tGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:17362/52‑1 (MQ=255)
          tGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:462093/51‑1 (MQ=255)
                        tggATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGAcgccgc  <  1:49048/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
ACGCTGGAAATGATCGCGCTGGGCTGGATGAACATCGGTGCTGCAGTTGCGCCTGACGCCGC  >  minE/1207160‑1207221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: