Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1219623	1220464	842	73 [0]	[0] 52	[yebR]–[yebS]	[yebR],[yebS]

TCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGA  >  minE/1219561‑1219622                                                              | tCGCAAAGAATTTTTTGTATTCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1000570/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCGGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:331100/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:560104/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:609820/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:647875/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:650579/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:656634/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:659801/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:686313/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:720445/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:743369/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:749458/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:753187/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:786189/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:787846/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:789205/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:789323/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:797305/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:892198/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:988681/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:967088/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:955706/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:939388/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:918410/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:917835/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:905892/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:901835/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:55306/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:887677/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:881104/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:839806/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:823115/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:806694/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:803380/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:799315/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:138263/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:522907/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:307037/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:291213/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:207043/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:202530/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:177690/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:172306/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:162701/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:314989/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:118252/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:109723/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:104231/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1028534/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1025096/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1023916/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1017015/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:1001912/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:408575/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:501847/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:500679/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:490972/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:44995/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:449650/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:413006/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:337008/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:394623/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:369863/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:360548/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:358618/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:358438/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:357813/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:349090/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:337672/62‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCATTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:603529/62‑1 (MQ=255)  cGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:888923/61‑1 (MQ=255)  cGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:954900/61‑1 (MQ=255)                   aaTCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGa  <  1:643844/44‑1 (MQ=255)                                                              | TCGCAAAGAATTTTTTGTAATCCGTCGTTGCAAGCACTTTTTCAAGCTGTGCCACAAGCTGA  >  minE/1219561‑1219622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑