Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1226330	1227113	784	83 [0]	[0] 27	[pphA]	[pphA]

GCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAC  >  minE/1226269‑1226329                                                             | tctccGGTATCAATATAATGCAGGTTGACAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:870401/4‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCACCGGTGTATGAc  >  1:884338/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:709491/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:763561/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:747633/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:739758/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:735870/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:731104/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:730795/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:721180/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:710934/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:786510/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:702588/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:69973/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:694105/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:667116/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:585582/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:548742/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:537467/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:535124/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:514936/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:1020579/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:900460/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:981337/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:974353/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:962682/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:962021/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:956069/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:953108/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:951810/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:950146/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:934433/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:781968/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:8920/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:88188/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:868468/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:804107/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:800584/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:794494/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:787510/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:504723/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:178776/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:496208/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:268690/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:26646/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:2499/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:226429/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:225144/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:219704/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:191341/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:188822/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:180088/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:274874/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:166200/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:149625/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:149055/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:141916/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:137849/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:121270/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:111740/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:105702/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:1024281/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:420175/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:491314/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:487860/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:483495/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:483056/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:45409/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:454058/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:443895/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:441746/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:284665/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:395794/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:390776/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:39060/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:353100/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:350730/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:341472/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:336531/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCAAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:328768/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATATAATGCACGTTCCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:842606/1‑61 (MQ=255) gCACCGGTATCAATAAAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:481939/1‑61 (MQ=255) gCACAGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAc  >  1:708167/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCACCGGTATCAATATAATGCAGGTTGCCAATATCCACGCGATGTCGCAACGGTGTATGAC  >  minE/1226269‑1226329

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑