Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1261292	1261372	81	13 [0]	[0] 13	torY	TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

CTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCA  >  minE/1261230‑1261291                                                              | cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:12728/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:273739/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:395564/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:418998/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:476556/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:510706/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:600502/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:677399/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:696392/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:70057/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:831134/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:881436/1‑62 (MQ=255) cTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCa  >  1:888176/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCTTGATACCTTCTTCACTTAATGTGGCTAGCGCCA  >  minE/1261230‑1261291

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑