Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1280417	1280869	453	64 [0]	[0] 21	yeeJ	adhesin

GCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGA  >  minE/1280358‑1280416                                                           | gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:864833/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:599183/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:600680/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:634014/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:647370/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:647407/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:663036/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:668068/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:715911/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:727454/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:75060/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:760582/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:818057/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:831339/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:834460/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:860071/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:562017/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:873797/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:884557/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:887771/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:88786/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:889199/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:895449/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:898395/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:922883/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:928596/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:938148/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:941290/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:944760/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:961920/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:993855/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:99801/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:252956/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:1025348/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:107217/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:109703/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:111051/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:148936/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:157666/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:168088/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:181789/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:192258/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:194130/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:206336/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:208368/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:214095/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:230916/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:246249/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:1022193/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:27786/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:2796/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:288636/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:306154/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:308491/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:334215/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:338042/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:39317/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:398848/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:415599/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:42160/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:429739/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:466465/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:503575/1‑59 (MQ=255) gCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGa  >  1:542802/1‑59 (MQ=255)                                                           | GCCTATACCAAAGGCAGTGGACTTACTGCGAAGCTATTAATGCAAAACTGGAATGAAGA  >  minE/1280358‑1280416

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑