Missing coverage evidence...
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GCGCTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCA  >  minE/101898‑101959                                                              | gcgcTGTCACTTTGTATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:692186/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:48691/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:942505/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:917639/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:851655/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:850396/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:80556/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:598604/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:576893/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:515502/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:1018413/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:433681/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:418949/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:355822/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:335524/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:271573/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:258394/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:222464/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:187394/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:1030381/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTCATCCCa  <  1:104223/62‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTATGCGTTATCCCa  <  1:774818/62‑1 (MQ=255)  cgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:32577/61‑1 (MQ=255)  cgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:293398/61‑1 (MQ=255)  cgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:793753/61‑1 (MQ=255)  cgcTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCa  <  1:83139/61‑1 (MQ=255)                            cgcgGCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTTTCCCa  <  1:513063/35‑1 (MQ=37)                                                              | GCGCTGTCACTTTGAATATTGCAGTTGCGCGTCCAGCCGGTGACGCCGTTTGCGTTATCCCA  >  minE/101898‑101959

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑