Missing coverage evidence...
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TACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAC  >  minE/1307550‑1307611                                                              | tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:752418/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:458190/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:458465/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:485866/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:48810/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:519361/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:543123/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:634881/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:717729/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:416971/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:824628/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:8732/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:875366/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:925782/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:937937/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:962499/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:992293/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:1003250/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:40678/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:393045/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:315824/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:315491/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:254101/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:219351/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:206928/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:185241/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:181708/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:14975/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:143721/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:103385/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:1029110/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAc  >  1:1022696/1‑62 (MQ=255) tACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATAGTCATTCTCCTTTAc  >  1:108508/1‑62 (MQ=255)                                                              | TACGCAATTCCACGCGAGAGGTGTTTGGAGTAACGTTATGCGACATGGTCATTCTCCTTTAC  >  minE/1307550‑1307611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑