Missing coverage evidence...
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ACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGT  >  minE/1312168‑1312228                                                             | aCTCACATGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:586070/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTGCTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:584283/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCTCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:478281/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:803597/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:637030/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:643477/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:702054/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:716563/1‑61 (MQ=255) aCTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGt  >  1:741615/1‑61 (MQ=255) 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                                                            | ACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGT  >  minE/1312168‑1312228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑