Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1338842	1339392	551	71 [0]	[0] 32	wcaD	predicted colanic acid polymerase

TTCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGAAA  >  minE/1338781‑1338841                                                             | ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACGGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:940494/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATGACCCCTGaaa  >  1:260684/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:598591/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:695359/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:695073/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:678893/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:673116/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:667650/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:639734/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:624930/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:618746/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:712951/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:577879/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:576326/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:559945/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:559217/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:556643/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:547337/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:523037/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:794967/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:999496/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:976751/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:933187/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:931212/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:872985/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:842124/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:811261/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:804473/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:706876/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:779007/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:764290/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:758250/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:746764/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:743566/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:736428/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:510173/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:173884/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:271924/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:259871/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:232623/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:230300/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:224164/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:204875/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:184310/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:177991/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:275248/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:17043/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:167990/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:149096/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:148151/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:131969/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:126817/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:124546/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:103929/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:39653/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:101858/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:505910/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:491799/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:489133/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:487544/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:445440/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:416427/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:403702/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:519476/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:365988/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:352613/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:350150/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:344262/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:310445/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:297189/1‑61 (MQ=255) ttCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGaaa  >  1:284692/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTCAGATATTGAAATGCCCACTCCAGCAAATAAAACAGGATAAAGGTCATAACCCCTGAAA  >  minE/1338781‑1338841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑