Missing coverage evidence...
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GCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCACGCCG  >  minE/1361970‑1362029                                                            | gCCCCTTCTGCCGGCAGCGCCTGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:175334/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:377252/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:959637/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:902341/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:84153/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:747053/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:537107/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:528535/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:501555/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:494344/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:488774/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:47099/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:468488/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:408143/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:396315/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:381103/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:1017616/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:3428/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:300811/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:256406/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:255877/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:219635/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:203284/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:182361/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:135578/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:126452/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:103436/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:1030849/60‑1 (MQ=255) gCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:101872/60‑1 (MQ=255)  ccccTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:207866/59‑1 (MQ=255)                  cgccagTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCAcgccg  <  1:55428/43‑1 (MQ=255)                                                            | GCCCCTTCTGCCGCCAGCGCCAGTGCCAGGTTTACCGCCGTGGACGATTTACCCACGCCG  >  minE/1361970‑1362029

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑