Missing coverage evidence...
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AGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCC  >  minE/1367357‑1367418                                                              | aGTACCGTTGGTGTACCTCGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:1024366/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGTCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:735100/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:707463/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:503366/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:523084/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:565511/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:567185/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:580053/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:65087/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:668399/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:680383/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:691645/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:442412/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:742518/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:823929/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:875954/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:911314/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:937931/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:9413/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:958740/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:97758/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:993714/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:272801/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:1030591/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:17011/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:212261/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:216927/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:221225/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:230374/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:247367/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:417787/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:292110/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:292501/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:294706/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:34241/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:363067/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:366267/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:38159/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:393862/62‑1 (MQ=255) aGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:405097/62‑1 (MQ=255)  gTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:268162/61‑1 (MQ=255)  gTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:939002/61‑1 (MQ=255)  gTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:137115/61‑1 (MQ=255)                      gCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGcc  <  1:415508/41‑1 (MQ=255)                                                              | AGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCC  >  minE/1367357‑1367418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑