Missing coverage evidence...
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AAATCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAC  >  minE/1401774‑1401835                                                              | taaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:680384/61‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:115439/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:878207/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:872389/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:871502/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:865165/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:825234/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:683893/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:679041/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:548749/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:531507/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:506562/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:504204/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:456967/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:436064/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:415918/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:382105/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:380975/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:357707/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:35730/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:342882/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:327317/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:231485/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:195454/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:187788/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:157309/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:129294/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:126434/62‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTTCCCGCAGTAAATTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:941169/62‑1 (MQ=255)  aaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:1020140/61‑1 (MQ=255)  aaTCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGATCCGTGCCGGTTCAAc  <  1:122206/61‑1 (MQ=255)                                                              | AAATCTGTTTCCCGCAGTAATTTGCGTACGGGTGATTTAGTTCTGTTCCGTGCCGGTTCAAC  >  minE/1401774‑1401835

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑