Missing coverage evidence...
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TGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTAA  >  minE/1418935‑1418996                                                              | tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCTTTGGCAGGTaa  <  1:369203/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:67098/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:511482/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:528680/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:543777/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:548393/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:566961/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:605817/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:622881/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:412822/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:717166/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:751637/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:765532/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:814123/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:884630/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:919014/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:941048/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:969367/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:26838/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:1030879/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:13651/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:155070/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:18539/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:196509/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:226377/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:23166/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:248611/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:269275/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:27095/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:315821/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:338940/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:357102/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:367090/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:1023812/62‑1 (MQ=255)  gTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTaa  <  1:448829/61‑1 (MQ=255)                                                              | TGTTGCATCGCCTGCGCGATACTACGTTCAATCACCGCACGGCGAGTATCGTTGGCAGGTAA  >  minE/1418935‑1418996

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑