Missing coverage evidence...
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GGTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCTT  >  minE/1440552‑1440612                                                             | ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:1035112/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:178669/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:328511/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:342412/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:537084/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:690904/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:721881/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:724166/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:745716/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:801703/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:85468/61‑1 (MQ=255) ggTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCtt  <  1:867587/61‑1 (MQ=255)                                                             | GGTTAAAATCAATAACTTATTCTTAAGTATTTGACAGCACTGAATGTCAAAACAAAACCTT  >  minE/1440552‑1440612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑