Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1442214	1442266	53	36 [0]	[0] 13	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCATT  >  minE/1442153‑1442213                                                             | gATCAGTAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:446767/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:764377/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:498716/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:500435/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:580455/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:624927/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:680104/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:686686/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:752822/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:76101/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:453768/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:792101/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:797933/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:804806/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:830815/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:89342/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:953213/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:960376/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:974602/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:207667/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:119914/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:123098/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:132042/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:155178/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:164489/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:167544/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:170147/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:189950/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:1008716/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:215993/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:270290/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:283582/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:294743/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:309137/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:360008/1‑61 (MQ=255) gATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCAtt  >  1:390663/1‑61 (MQ=255)                                                             | GATCAGGAATCGAACCGCACTGTCATAAGTAACAAAATTGCCGATCATTTGCTGCCGCATT  >  minE/1442153‑1442213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑