Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1447630	1447837	208	97 [0]	[0] 54	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

TACCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCTT  >  minE/1447568‑1447629                                                              | taCCGGAGAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:909123/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:73143/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:828480/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:816254/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:814879/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:812493/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:80762/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:807618/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:781183/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:763202/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:753006/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:743504/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:732955/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:840729/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:722082/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:685771/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:681493/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:660009/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:641478/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:631106/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:612979/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:605382/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:586498/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:581213/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:560125/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:944853/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:987789/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:987617/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:978805/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:973765/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:966146/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:962633/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:956388/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:954486/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:949141/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:948565/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:947486/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:837181/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:938804/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:935293/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:930247/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:916246/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:91089/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:889024/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:888224/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:887851/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:878119/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:852601/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:556735/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:198542/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:346979/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:332477/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:331310/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:317171/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:312327/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:289505/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:277884/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:266337/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:249009/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:24591/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:228472/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:372710/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:171004/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:170740/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:157003/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:154075/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:12913/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:120245/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:113191/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:1036291/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:103536/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:1017359/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:1003167/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:454586/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:552679/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:548619/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:530837/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:530436/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:507805/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:504009/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:498017/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:493237/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:472826/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:471463/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:455772/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:1000733/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:433199/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:428219/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:425184/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:425143/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:423902/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:406784/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:401558/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:398785/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:387118/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:385296/1‑62 (MQ=255) taCCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCtt  >  1:373968/1‑62 (MQ=255)                                                              | TACCGGACAAGACTAGTGGATTTCAGCATGCATTATATGAAGTGGATTTATCCACGCCGCTT  >  minE/1447568‑1447629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑