Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1460090	1460221	132	65 [0]	[0] 4	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

AGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAA  >  minE/1460029‑1460089                                                             | aGCGAGAATTTAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:822268/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:665316/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:805723/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:795460/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:778935/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:770896/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:745081/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:698626/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:691161/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:565606/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:663782/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:648599/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:647246/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:640012/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:637656/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:633893/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:564040/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:822471/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:826781/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:828281/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:857695/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:865614/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:873351/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:879006/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:879868/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:890177/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:927217/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:941343/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:949204/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:951274/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:960755/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:986297/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:283670/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:1034919/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:112924/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:1142/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:115789/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:135435/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:157420/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:160326/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:176667/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:192590/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:207361/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:213757/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:240111/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:258724/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:279107/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:281172/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:37721/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:560933/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:554204/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:551254/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:492362/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:487890/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:433940/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:384790/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:1004304/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:3287/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:327301/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:317761/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:315810/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:305573/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:30423/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:297874/1‑61 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATAGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGaaa  >  1:914163/1‑61 (MQ=255)                                                             | AGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAA  >  minE/1460029‑1460089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑