Missing coverage evidence...
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CTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATA  >  minE/1506108‑1506169                                                              | cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTAGGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:884574/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:506779/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:769896/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:761246/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:7176/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:810353/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:708634/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:706396/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:610883/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:601620/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:881532/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:530601/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:451699/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:418667/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:32965/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:319238/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:98204/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:276141/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:266800/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:211708/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:184288/62‑1 (MQ=255) cTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:121526/62‑1 (MQ=255) cTTCACGCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:151100/62‑1 (MQ=255)  ttCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:709968/61‑1 (MQ=255)  ttCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:587667/61‑1 (MQ=255)  ttCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:535285/61‑1 (MQ=255)  ttCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATa  <  1:289258/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTTCACTCACCTCTTCCGGTAAGTTCAGCGCTACGAAGTCGCGGCCCTGTTTGGCCAGCATA  >  minE/1506108‑1506169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑