Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1523886	1524099	214	36 [0]	[0] 69	flk	predicted flagella assembly protein

CGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAT  >  minE/1523824‑1523885                                                              | cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:629876/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:1014070/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:41559/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:577013/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:579454/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:592407/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:603510/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:607892/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:610473/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:407535/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:68037/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:70366/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:719352/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:841550/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:854043/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:870201/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:899399/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:984351/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:263407/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:11475/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:125306/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:138941/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:180044/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:229251/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:24329/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:251919/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:341129/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:271281/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:29786/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:302866/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:305358/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:319618/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:322390/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:326472/62‑1 (MQ=255) cGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:338777/62‑1 (MQ=255)  gAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAt  <  1:822193/61‑1 (MQ=255)                                                              | CGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAAT  >  minE/1523824‑1523885

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑