Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1536326	1536389	64	90 [0]	[0] 52	yfcR	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTTCTC  >  minE/1536264‑1536325                                                              | cTTCATCATCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:680053/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCATCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:355878/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACATAGGAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:220137/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAGGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:997635/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:818192/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:538832/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:797463/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:788333/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:757226/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:734540/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:734261/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:728691/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:712234/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:705405/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:696176/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:688416/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:684048/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:658058/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:652237/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:627740/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:621590/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:600729/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:546139/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:531287/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:8907/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:995797/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:99362/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:985701/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:969737/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:960184/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:959648/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:953924/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:933805/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:931433/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:92130/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:825199/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:88609/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:875233/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:872301/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:86672/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:861312/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:85753/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:854105/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:852904/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:84335/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:831692/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:178509/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:535674/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:241366/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:23689/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:235237/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:213370/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:207109/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:200432/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1931/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:185279/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:183577/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:241551/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:177267/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:160034/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:156606/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:153355/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:129558/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:113401/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1024579/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1016590/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1012656/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1011816/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:429186/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:1007798/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:520351/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:520239/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:51884/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:49524/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:493764/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:47329/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:469346/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:458144/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:248099/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:424337/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:409832/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:387446/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:360814/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:357821/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:331715/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:315562/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:283341/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:278001/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:269176/1‑62 (MQ=255) cTTCATCAGCAGCATGAGCTAAGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTtctc  >  1:163229/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTCATCAGCAGCATGAGCTATGGCGCTACTGACACAAAGCAGGGTTAAGAAAGTCTTTCTC  >  minE/1536264‑1536325

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑