Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1538650	1539100	451	49 [0]	[0] 80	yfcU	predicted export usher protein

TGCTGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCC  >  minE/1538588‑1538649                                                              | tgctgcCCATATTGAAATATTGGGAGAGCATGATTTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:528594/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACTATcc  <  1:348605/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:717561/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:524452/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:550337/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:566900/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:595279/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:603862/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:643040/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:65680/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:706433/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:116687/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:731409/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:801434/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:804084/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:870192/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:90990/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:918910/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:919388/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:951513/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:958844/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:467899/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:1029437/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:14499/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:183552/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:194842/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:203000/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:204668/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:248539/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:281925/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:31155/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:336756/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:362207/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:398552/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:400544/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:523893/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:406808/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:460169/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:442606/62‑1 (MQ=255) tgctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGAAGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:595503/62‑1 (MQ=255)  gctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:970592/61‑1 (MQ=255)  gctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:968219/61‑1 (MQ=255)  gctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:967589/61‑1 (MQ=255)  gctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:914192/61‑1 (MQ=255)  gctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:784033/61‑1 (MQ=255)  gctgcACATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:373523/61‑1 (MQ=255)   ctgcCCATATTGAAATAGTGGGTGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:43928/60‑1 (MQ=255)   ctgcCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:854991/60‑1 (MQ=255)            ttGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATcc  <  1:907759/51‑1 (MQ=255)                                                              | TGCTGCCCATATTGAAATAGTGGGAGAGCATGATGTTGTAGTTTGTCTGCTCCTCACGATCC  >  minE/1538588‑1538649

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑