Missing coverage evidence...
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GGCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCA  >  minE/1540684‑1540744                                                             | ggCTTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGTTATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:849936/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:69112/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:899996/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:868611/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:842759/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:833018/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:796017/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:79197/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:763196/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:751979/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:696186/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:692113/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:126759/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:66579/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:643822/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:637970/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:57446/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:516829/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:501397/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:44057/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:376000/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:357412/61‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:166029/61‑1 (MQ=255)               gTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCa  <  1:550978/47‑1 (MQ=255)                                                             | GGCGTGGTGGTGCCGTTATTTTTCAGTTTTTCGGCACCGATATCACCCATATCAACTTCCA  >  minE/1540684‑1540744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑