Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557466	1558014	549	8 [0]	[0] 9	[emrY]–[emrK]	[emrY],[emrK]

AATAAACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAA  >  minE/1557405‑1557465                                                             | aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:302346/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:320144/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:59513/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:656756/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:743608/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:878094/61‑1 (MQ=255) aataaACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:930502/61‑1 (MQ=255)                      aTTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTaaaaa  <  1:40595/40‑1 (MQ=255)                                                             | AATAAACTCTATGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAA  >  minE/1557405‑1557465

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑