Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562527	1562583	57	19 [0]	[0] 12	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

ACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCA  >  minE/1562467‑1562526                                                            | aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:685040/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:95976/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:932365/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:905877/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:83170/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:804414/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:794309/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:761947/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:729278/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:724658/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:133325/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:644623/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:591976/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:434911/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:406195/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:273482/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:269872/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:269682/1‑60 (MQ=255) aCCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTacca  >  1:212395/1‑60 (MQ=255)                                                            | ACCCTCAGGCGTTTAAGCAGGTCTTATCAAATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCA  >  minE/1562467‑1562526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑