Missing coverage evidence...
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CCTTCCAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTT  >  minE/1570564‑1570625                                                              | ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:825844/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:650244/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:651020/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:659687/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:664066/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:678937/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:696445/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:71835/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:751962/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:805574/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:814815/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:818369/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:101901/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:834945/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:838400/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:846461/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:858686/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:869989/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:870520/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:91238/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:922169/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:935844/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:950161/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:614477/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:122261/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:122439/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:154312/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:168154/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:194184/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:255449/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:288360/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:327857/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:33232/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:333029/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:366266/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:429714/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:439457/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:478545/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:51437/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:546864/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:559742/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:586737/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:640789/62‑1 (MQ=255) ccttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGGTTCCAACGAGtt  <  1:1007270/62‑1 (MQ=255)  cttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:541018/61‑1 (MQ=255)  cttccAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:692509/61‑1 (MQ=255)              cACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGtt  <  1:985174/49‑1 (MQ=255)                    aaGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTCTCCAACGAGtt  <  1:80206/43‑1 (MQ=255)                                                              | CCTTCCAGTGAAGCACTGCAAGTGGGCAGTATCATGGCGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTT  >  minE/1570564‑1570625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑