Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1593851	1594069	219	81 [0]	[0] 33	[cysA]–[cysW]	[cysA],[cysW]

CTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTAA  >  minE/1593791‑1593850                                                            | cTGAAGGATTATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:215987/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGTTATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:643062/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:62997/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:729331/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:722852/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:705965/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:701764/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:691735/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:684651/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:67358/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:659398/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:650316/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:742029/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:610213/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:599220/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:554045/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:550931/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:550831/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:517000/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:516610/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:514111/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:879075/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:987511/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:987208/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:975079/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:9718/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:943648/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:936775/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:928547/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:926609/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:89859/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:741881/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:866702/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:838886/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:817053/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:810708/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:798217/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:753606/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:745223/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:744498/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:511642/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:236918/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:1005441/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:336315/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:334534/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:318999/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:308095/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:254127/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:251754/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:245152/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:238722/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:336462/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:229506/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:229291/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:180823/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:139155/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:138595/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:124913/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:124892/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:121108/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:1018681/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:408877/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:487846/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:485965/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:483832/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:476387/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:473857/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:471212/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:463358/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:423554/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:407088/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:405251/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:396398/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:373093/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:372500/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:362432/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:348430/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:342475/60‑1 (MQ=255) cTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTAGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:739366/60‑1 (MQ=255)  tGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:242883/59‑1 (MQ=255)  tGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTaa  <  1:431385/59‑1 (MQ=255)                                                            | CTGAAGGAATATCCAGTGAGATATCGTTCAGCACCTGGGTGCGACCAAACGACTTCTTAA  >  minE/1593791‑1593850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑