Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1605506	1605517	12	48 [0]	[0] 48	amiA	N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase I

CCAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGCC  >  minE/1605451‑1605505                                                       | ccAGGTGCTTAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:799466/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGCCGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:652797/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCGGGAATGTCGCAAGcc  >  1:45736/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:808634/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:592252/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:621280/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:621338/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:628206/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:640934/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:675575/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:678564/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:692830/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:798198/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:591295/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:855855/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:860552/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:861492/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:862393/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:869114/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:890386/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:927128/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:934966/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:947092/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:975551/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:981699/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:581883/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:1030462/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:107188/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:148970/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:150978/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:158314/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:183878/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:215529/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:259768/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:263603/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:312166/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:335347/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:365272/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:366373/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:394374/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:442354/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:446288/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:469735/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:487502/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:510388/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:539270/1‑55 (MQ=255) ccAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:1004714/1‑55 (MQ=255)  cAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGcc  >  1:343760/1‑54 (MQ=255)                                                       | CCAGGTGCTGAAAGCCGGTTTGGCTGCCCTGACGTTGTCAGGAATGTCGCAAGCC  >  minE/1605451‑1605505

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑