Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1605984	1606030	47	59 [0]	[0] 33	amiA	N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase I

TGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATC  >  minE/1605922‑1605983                                                              | tGAAGTTGCCTGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:743304/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTTACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:62397/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:715169/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:1000481/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:570108/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:5750/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:576178/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:580638/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:582957/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:586674/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:603579/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:607024/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:627168/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:643277/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:684000/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:687318/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:56546/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:715634/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:718861/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:724375/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:738938/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:794895/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:816574/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:84658/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:859072/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:867280/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:927022/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:961663/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:962651/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:541764/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:1008902/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:117749/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:121859/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:134449/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:161193/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:200554/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:229016/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:274560/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:277511/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:29192/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:33278/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:349272/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:403587/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:543685/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:527/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:480564/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:476235/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:463096/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:452837/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:410479/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:389263/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATCGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:904018/62‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGAGCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:277533/62‑1 (MQ=255) tGAAGATGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:262397/62‑1 (MQ=255)  gAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:469684/61‑1 (MQ=255)  gAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:331302/61‑1 (MQ=255)                 aaGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:874599/46‑1 (MQ=255)                     cGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:502807/42‑1 (MQ=255)                      gACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATc  <  1:474050/41‑1 (MQ=255)                                                              | TGAAGTTGCCGGTAAAAAGGCGACTGACAAGGATCACCTATTGCAACAAGTGCTGTTTGATC  >  minE/1605922‑1605983

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑