Missing coverage evidence...
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CACCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATCCC  >  minE/1611588‑1611649                                                              | cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:636304/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:946508/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:924579/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:904906/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:873110/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:867381/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:858462/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:832515/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:729689/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:728316/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:669481/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:666075/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:655352/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:647683/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:592242/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:518586/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:1030402/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:135593/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:176457/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:194602/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:228229/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:234600/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:358369/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:372046/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:395329/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:419161/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:464100/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:563828/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGAACATccc  <  1:238997/62‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGCCGCCACGCGATCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:1000424/62‑1 (MQ=255)  acCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:932694/61‑1 (MQ=255)  acCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACAAccc  <  1:316014/61‑1 (MQ=255)        tttGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:902875/55‑1 (MQ=255)                   gcgcTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATccc  <  1:747596/44‑1 (MQ=255)                                                              | CACCTGCTTTGCCGCCACGCGCTCCTGTGAGCTTGCCGCTGCGACGCCCGCCAGCACATCCC  >  minE/1611588‑1611649

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑