Missing coverage evidence...
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AAATAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTGG  >  minE/131112‑131172                                                             | aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATTGTAACGAAGCTgg  <  1:16224/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCggg  <  1:49619/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:372293/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:951675/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:945352/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:820762/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:714464/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:708140/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:65441/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:531459/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:442004/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:282411/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:26386/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:257182/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:255330/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:240441/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:131928/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:103775/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:1029285/61‑1 (MQ=255) aaaTAGGCGACGTTGGGGCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:1022274/61‑1 (MQ=255)  aaTAGGCGACGTTGGGTCGCGAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:804528/60‑1 (MQ=255)  aaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:1007419/60‑1 (MQ=255)  aaTAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTgg  <  1:948507/60‑1 (MQ=255)                                                             | AAATAGGCGACGTTGGGTCGCCAGGTGCGAGCTTCTTCATCTGGCATGGTAACGAAGCTGG  >  minE/131112‑131172

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑