Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1646236	1646257	22	32 [0]	[0] 44	gcvR	DNA‑binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA

TTGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAT  >  minE/1646174‑1646235                                                              | ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:551472/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:988432/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:960388/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:934744/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:909336/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:869493/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:807385/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:775993/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:722952/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:655826/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:638577/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:601436/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:596161/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:579515/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:567133/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:566213/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:1016235/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:542969/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:526188/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:477774/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:411690/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:372943/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:340872/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:282332/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:243363/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:179967/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:174704/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:169183/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:168077/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:130914/62‑1 (MQ=255) ttGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:130646/62‑1 (MQ=255)                    aTTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAt  <  1:521921/43‑1 (MQ=255)                                                              | TTGACACTGTCATCGCAACATTATCTGGTGATCACTGCGTTGGGTGCCGATCGCCCTGGAAT  >  minE/1646174‑1646235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑