Missing coverage evidence...
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CCATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTG  >  minE/1668325‑1668386                                                              | ccATGCCCGTGCTGATAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:401291/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTCCTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:51956/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:7841/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:641101/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:656004/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:674998/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:682611/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:719067/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:724278/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:724647/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:772611/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:572998/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:79515/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:797278/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:819783/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:837660/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:889223/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:914794/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:943472/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:959454/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:406362/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:143031/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:192915/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:21958/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:283541/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:286386/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:332916/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:349942/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:375325/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:612380/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:407144/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:447814/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:465304/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:485040/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:492403/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:562092/1‑62 (MQ=255) ccATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTg  >  1:1033183/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCATGCCCGTGCTGACAGAAGTAATCTACTGCACCACAGGCTTTTAACACCTGCAACGGTTG  >  minE/1668325‑1668386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑