Missing coverage evidence...
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CGCCGTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACATCT  >  minE/1673004‑1673065                                                              | cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:246504/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:320712/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:1030984/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:414172/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:467636/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:518789/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:947153/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:919843/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:626114/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:904770/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:663257/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:867635/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:865859/62‑1 (MQ=255) cgccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:856499/62‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGGGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:993249/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAATGTGTACAtct  <  1:633242/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:789503/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:779511/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:524090/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:370090/61‑1 (MQ=255)  gccgTCCCTTCAGGGCGCAGAGGCAGGCTGGCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACAtct  <  1:592259/61‑1 (MQ=255)                                                              | CGCCGTCCCTTCAGGGCGCAGAGTCAGGCTGTCGCCATTGCGATCCTCAAAGGTGTACATCT  >  minE/1673004‑1673065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑