Missing coverage evidence...
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TGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCAA  >  minE/1718454‑1718494                                         | tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:565792/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:920356/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:890473/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:747248/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:74703/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:743335/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:741227/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:731395/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:730821/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:7020/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:701233/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:683794/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:570765/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:114217/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:551739/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:519696/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:510799/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:466035/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:358950/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:293675/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:257795/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:250190/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:220762/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:160119/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:15565/41‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:120832/41‑1 (MQ=255)      ggCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCaa  <  1:779937/36‑1 (MQ=255)                                         | TGCAGGGCTATTTTTTATAAGATGCATTTGAGATACATCAA  >  minE/1718454‑1718494

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑