Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1720502	1720522	21	61 [0]	[0] 20	yfhA	predicted DNA‑binding response regulator in two‑component system

CGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGTT  >  minE/1720440‑1720501                                                              | tggCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:956127/2‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGACCGCGCGGACAAACGGtt  >  1:611804/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:791699/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:555629/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:580844/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:582875/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:603297/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:609934/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:655797/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:669995/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:692090/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:694816/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:701516/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:722924/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:730504/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:734716/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:741268/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:547686/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:795587/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:804322/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:895608/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:929309/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:932107/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:941946/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:942704/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:95110/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:955791/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:956010/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:956618/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:963548/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:968152/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:329758/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:104593/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:132345/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:135728/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:135983/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:168923/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:173746/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:178050/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:191257/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:199014/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:248631/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:273906/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:282151/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:286372/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:291019/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:102722/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:341785/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:359785/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:362589/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:37037/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:381300/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:445216/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:447477/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:460305/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:464077/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:470857/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:477468/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:52603/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:527355/1‑62 (MQ=255) cGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGtt  >  1:540108/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGCCAGCTCGCGGTCATCAGGCGTTTCATCGCATCGGTAGAGAACGCGCGGACAAACGGTT  >  minE/1720440‑1720501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑