Missing coverage evidence...
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ATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGA  >  minE/1806051‑1806111                                                             | aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:779403/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:615072/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:625813/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:639022/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:681990/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:684981/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:695316/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:696416/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:705668/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:765778/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:775680/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:594231/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:802190/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:804988/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:887821/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:89042/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:891394/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:891922/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:928068/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:947140/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:97886/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:982667/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:359395/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:118757/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:138146/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:152842/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:15958/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:177018/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:21609/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:216367/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:229176/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:342529/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:354805/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:100929/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:396477/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:429613/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:436169/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:480179/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:485443/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:497177/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:519585/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:520895/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:5312/1‑61 (MQ=255) aTTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGa  >  1:540852/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATTGCGTCGTGGGCGTGTGGTGTCTCCAGCAGCCTGAATATGCTGATCTTCTTCCGCGTGA  >  minE/1806051‑1806111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑