Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	148403	149323	921	85 [0]	[0] 5	[hrpB]	[hrpB]

CGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGC  >  minE/148351‑148402                                                    | cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:649393/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:762249/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:755876/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:73701/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:732785/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:714941/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:708389/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:677674/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:676061/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:663027/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:656167/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:787934/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:638826/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:614807/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:609562/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:609231/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:605593/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:605042/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:603621/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:1010792/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:590237/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:898645/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:992734/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:982465/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:972194/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:96430/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:963454/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:944330/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:943105/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:934464/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:927697/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:60144/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:890734/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:888239/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:88808/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:857054/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:823396/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:81747/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:816172/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:802694/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:797604/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:259239/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:457550/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:412336/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:584224/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:36155/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:332650/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:323575/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:283813/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:279810/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:272090/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:380431/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:234162/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:222694/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:215633/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:185466/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:158102/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:136587/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:105018/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:1035297/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:1013436/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:559001/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:55671/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:556796/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:538847/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:535380/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:532582/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:477079/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:524902/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:510487/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:503087/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:502957/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:564589/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:496114/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:566097/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:49464/1‑52 (MQ=255) cgCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:571831/1‑52 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:242806/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:966323/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:211936/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:862826/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:827807/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:724905/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:478767/1‑45 (MQ=255)        ggCAAGATGGACGATATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGc  >  1:498088/1‑45 (MQ=255)                                                    | CGCCGTGGGCAAGATGGACGCTATCAACTGGCAAACGGCATGGGAGCGATGC  >  minE/148351‑148402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑