Missing coverage evidence...
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CTGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC  >  minE/1847884‑1847945                                                              | ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAtctc  <  1:1018472/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:48917/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:985506/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:939370/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:933647/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:933522/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:911495/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:734157/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:638892/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:611295/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:600781/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:5796/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:545926/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:529593/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:522980/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:1004545/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:458712/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:44249/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:357829/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:320262/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:291935/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:290532/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:233662/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:226894/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:147983/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:135575/62‑1 (MQ=255) ctGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAActc  <  1:1018459/62‑1 (MQ=255)                                                              | CTGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC  >  minE/1847884‑1847945

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑