Missing coverage evidence...
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CAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTCC  >  minE/1859485‑1859545                                                             | cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:481134/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:948745/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:942064/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:892626/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:883419/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:821313/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:795259/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:762407/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:719144/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:617880/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:48834/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:4852/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:1001430/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:427607/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:419938/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:416658/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:408532/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:38117/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:36064/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:300877/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:269719/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:221474/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:193585/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:19012/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:143592/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:1036684/61‑1 (MQ=255) cAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGAGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:867363/61‑1 (MQ=255)   aTGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTcc  <  1:942124/59‑1 (MQ=255)                                                             | CAATGGTGCCGCGCAGGTAGTTGCTTTCATGCTTCATGCGCTCGGCGTCTGTCAGTTTTCC  >  minE/1859485‑1859545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑