Missing coverage evidence...
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TAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACTT  >  minE/1877447‑1877504                                                          | tAAACTGAAACTCCAGACAAACAATGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:110076/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:766103/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:618684/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:62772/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:68498/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:690385/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:704590/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:707335/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:71906/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:730079/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:615363/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:818274/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:855286/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:868667/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:869344/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:893541/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:9175/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:991602/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:61117/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:103857/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:114298/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:142237/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:24282/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:305468/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:306711/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:321123/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:486772/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:499911/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:512408/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:549831/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:553729/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:591377/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:607484/58‑1 (MQ=255) tAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:1038329/58‑1 (MQ=255)  aaaCTGAAACTCCAGACAAACACCGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:518956/57‑1 (MQ=255)  aaaCTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:857523/57‑1 (MQ=255)         aaCTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACtt  <  1:747734/50‑1 (MQ=255)                                                          | TAAACTGAAACTCCAGACAAACAACGCGTACCCAGGGTACGCGTTGCCGCTCTAACTT  >  minE/1877447‑1877504

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑