Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1881822	1881825	4	33 [0]	[0] 7	relA	(p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase

TGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGC  >  minE/1881780‑1881821                                          | tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:535819/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:914600/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:886777/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:879367/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:800605/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:79366/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:748771/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:656423/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:652710/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:64074/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:629865/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:590209/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:577510/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:566188/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:56427/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:1003047/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:510973/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:1010576/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:1017860/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:115276/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:132768/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:241408/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:256051/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:277421/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:316124/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:381328/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:422064/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:465345/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:499153/42‑1 (MQ=255) tGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:53420/42‑1 (MQ=255)  gAACGGCACAATGCTCCAGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:637350/41‑1 (MQ=38)   aaCGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:366336/40‑1 (MQ=255)   aaCGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGc  <  1:633607/40‑1 (MQ=255)                                          | TGAACGGCACAATGCGCCCGCCAATTTTTGCCCCGATGCAGC  >  minE/1881780‑1881821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑