Missing coverage evidence...
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GTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGG  >  minE/1894409‑1894470                                                              | gTGCGCATCCACGGACGCGTGTTTGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:52967/62‑1 (MQ=17) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:421307/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:902497/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:879141/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:867515/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:8613/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:757341/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:731470/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:717495/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:696158/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:661111/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:653222/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:508790/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:428195/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:407810/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:254740/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:1019830/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:120953/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:122723/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:206492/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:214563/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:24270/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:250986/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:281432/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:315705/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:316552/62‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:343890/62‑1 (MQ=255)  tGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:348759/61‑1 (MQ=255)  tGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:795077/61‑1 (MQ=255)  tGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:4562/61‑1 (MQ=255)  tGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:1004039/61‑1 (MQ=255)             ggACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAgg  <  1:277327/50‑1 (MQ=32)                                                              | GTGCGCATCCACGGACGCGGGGTGGAGCAGCCTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGG  >  minE/1894409‑1894470

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑