Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2009207	2010008	802	79 [0]	[0] 66	yghW–[yghX]	yghW,[yghX]

GGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGTT  >  minE/2009145‑2009206                                                              | ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGGAAGATAATACGTATGtt  <  1:353085/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATAGGTATGtt  <  1:493590/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:624244/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:702846/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:702149/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:67860/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:678170/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:67342/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:672231/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:647913/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:631677/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:780014/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:60059/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:597463/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:562310/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:518061/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:511612/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:507398/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:460839/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:927615/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:999440/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:997487/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:978984/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:977039/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:972358/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:969716/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:928742/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:92765/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:1009453/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:9189/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:872169/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:868838/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:864336/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:859770/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:857472/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:818100/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:817082/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:139994/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:31036/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:460374/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:280205/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:196018/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:191767/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:186768/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:183726/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:149106/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:148878/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:309658/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:13674/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:125116/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:116449/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:11230/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:1022844/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:1021713/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:10194/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:1001807/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:315062/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:343544/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:428284/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:343941/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:34459/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:345508/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:424754/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:347719/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:419484/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:418683/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:363720/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:37079/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:391454/62‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACCTATGtt  <  1:985555/62‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:680733/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:405890/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:638501/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:668951/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:259520/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:792064/61‑1 (MQ=255)  gcgcTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAACAAGATAATACGTATGtt  <  1:498492/61‑1 (MQ=255)       aaaaCGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:942388/56‑1 (MQ=255)                         aTTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGtt  <  1:347742/38‑1 (MQ=255)                                                              | GGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGTT  >  minE/2009145‑2009206

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑